《表3 癌症紊乱PPI基因对的KEGG信号通路聚类》

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《PPI基因对在癌症中的共表达分析》

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通过表2可以知道，在正常样本中，PPI基因对在表达上具有较高相关性的数目较多，平均有1 700对，而在肿瘤中降低到平均不足300对．这些PPI基因对在机体中应该能够正常发挥其功能并产生重要作用．然而，这些PPI基因对在癌症中的相关系数相比在正常组织中显著降低（见图2），这说明很大一部分正常功能的PPI基因对在癌症中发生了紊乱，很可能对癌症的发生、发展产生重要影响．为了寻找癌症中紊乱的PPI基因对，筛选在正常组织中具有共表达（R2>0.64）而在癌症中相关性低（R2<0.09）的PPI基因对，定义为癌症紊乱的PPI基因对．从11种癌症中共筛选了2 812对癌症紊乱PPI基因对，存在于至少2种癌症的紊乱PPI基因对有353对．对这353对PPI基因对共520个基因进行KEGG信号通路聚类分析，结果显示有48个信号通路能够显著聚类（P值经过Bonferroni校正后小于0.01），其中共有15个信号通路与癌症相关（见表3），除了本研究涉及的癌症，还参与了急性和慢性粒细胞白血病、胶质瘤、子宫内膜癌等疾病的发生，此外还与蛋白聚糖、胆碱代谢等生理活动有关．蛋白聚糖是细胞外基质的主要成分之一，与肿瘤的浸润和转移有密切的关系，影响着新生血管的形成及癌细胞的扩散[22]；癌症中胆碱代谢异常，导致磷酸胆碱含量增加，从而促进细胞增殖[23]．以上说明这类癌症紊乱的PPI基因对异常很可能会影响到癌症的发生、发展过程．