《表2 KEGG信号通路的基因富集分析汇总表》

《表2 KEGG信号通路的基因富集分析汇总表》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《基于计算机文本挖掘的白内障氧化应激相关基因功能富集及药物治疗分析》


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通过GeneCodis的基因功能富集,从103个基因中筛选出22个基因,这22个基因对应了31个生物学过程的GO术语。基因富集的统计显著性计算采用矫正的超几何方法(P value,P值),按照P值由小到大进行排序,排在前三位的GO术语分别为:线粒体中细胞色素C的释放(P=4.10×10-7),包含4个基因;细胞凋亡的负调控(P=2.35×10-6),包含6个基因;线粒体膜电位的调控(P=3.04×10-6),包含3个基因。选取排序在前10位的GO术语中所包含的基因(表1)。同时,将22个基因进行KEGG信号通路的功能富集,然后依旧按照P值由小到大排序,前三位的通路分别为:肌萎缩性脊髓侧索硬化症(P=9.69×10-9),包含了5个基因;癌症相关信号通路(P=1.56×10-6),包含了6个基因;亨廷顿舞蹈症(P=8.69×10-5),包含了4个基因。选取排序在前7位的KEGG通路中所包含的基因(表2)。通过以上基因的生物学过程和KEGG通路功能富集筛选,最终得到11个基因。