《表1 核心差异基因:一种基于PPI网络的乳腺癌差异基因分析算法》

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《一种基于PPI网络的乳腺癌差异基因分析算法》


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将核心差异基因结合患者的生存状态进行生存分析,利用TCGA数据库下载乳腺癌临床信息文件,提取其中患者的随访时间或死亡时间以及生存状态,结合基因表达数据,利用R软件survival包进行生存分析,得到图6所示的生存曲线.研究结果显示,这些与乳腺癌患者生存率相关的基因,在患者中的过度表达与其生存率低相关,表明这些基因很可能与乳腺癌预后不良有关.同时利用cosmic数据库,提取单一差异基因在乳腺癌中的突变概率,与其发生突变概率的最高基因位点信息,通过基因突变概率最高的位点,可为以后的研究提供更为准确的方向,同时结合患者观察2周后的生存率,绘制出如下表格.从表1可以直观地看出,基因突变概率高的患者生存率较低.