《表4 小拟南芥MKK复制基因对的Tajima相对速率测验》
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《小拟南芥MKK基因家族全基因组鉴定及进化和表达分析》
Tajima相对速率测试用于检验小拟南芥旁系同源物之间进化速率的相等性;Mt是3个测试序列中相同位点的总和;M1是复制基因对第1个基因中特异差异位点的数量;M2是复制基因对第2个基因中特异差异位点的数量;如果P<0.05,则测试拒绝两个重复样本之间的相等替换率,并推断两个重复
进化选择的模式可以通过Ka/Ks来估算,Ka/Ks>1表示正选择,Ka/Ks<1表示纯化选择,Ka/Ks=1表示中性选择[49]。7个ApMKK复制基因对的Ka/Ks皆小于1,表明它们都经过了纯化选择(表3)。本研究进一步对MKK基因家族中的复制基因对进行Tajima相对速率测验,以评估复制事件发生后ApMKK复制基因是否加速进化。结果发现,复制基因对ApMKK1-1/1-2之间的进化速率(P<0.05)发生了统计学意义上的增加,表明这两个复制基因可能存在潜在的功能差异(表4)。
图表编号 | XD00140608000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.01 |
作者 | 李晓翠、康凯程、黄先忠、范永斌、宋苗苗、黄韵杰、丁佳佳 |
绘制单位 | 石河子大学生命科学学院植物基因组学实验室、石河子大学生命科学学院植物基因组学实验室、安徽科技学院农学院、石河子大学生命科学学院、石河子大学生命科学学院植物基因组学实验室、石河子大学生命科学学院植物基因组学实验室、石河子大学生命科学学院植物基因组学实验室、石河子大学生命科学学院植物基因组学实验室 |
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