《表2 SWEET同源基因对的比对结果和复制基因对的分化时间》

《表2 SWEET同源基因对的比对结果和复制基因对的分化时间》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《南瓜SWEET蛋白家族的全基因组鉴定与进化分析》


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注:N表示没有。下同。

由图1可知,共有21个CmSWEET基因位于21条染色体中的13条染色体上。染色体Cmo15含有最多的CmSWEET基因(4个,19%),而染色体Cmo00、Cmo01、Cmo03、Cmo05、Cmo07、Cmo09、Cmo19和Cmo20上没有Cm SWEET基因。染色体Cmo10上含有3个CmSWEET基因,染色体Cmo11、Cmo12和Cmo13上都含有2个CmSWEET基因,其余每一条染色体含有1个CmSWEET基因。由表2可知,共线性分析发现共有4对同源基因对,分别是Cm SWEET1a_Cm SWEET1b、Cm SWEET12a_Cm SWEET12d、Cm SWEET10a_Cm SWEET10b、Cm SWEET7b_Cm SWEET7c,其中依据氨基酸序列一致性>80%和基因比对覆盖率>0.75,本研究在中国南瓜染色体上共发现1对片段复制基因对(CmSWEET10b_CmSWEET10a),Ka/Ks<1.0表明这些复制对主要经历了纯化选择,分化时间为20.13 MYA。