《表4 候选区域内的24个开放阅读框》

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《水稻粉质皱缩胚乳突变体fse4的表型分析与基因克隆》


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利用fse4杂合植株(FSE4fse4)与籼稻品种Dular杂交配组,从F2群体中挑选与突变体亲本表型一致的粉质皱缩种子,用于FSE4的精细定位。使用79个隐性个体将FSE4定位于第5染色体长臂,分子标记I5-9和N5-29之间约13 c M区间内(图5-A)。进一步利用1568个隐性个体将区间限定在TI2和TI6之间约252 kb区间内(图5-B)。通过RiceXPro网站预测,该区间内含有24个开放阅读框(Open reading frames,ORFs)(表4)。测序发现,突变体fse4的Os05g0455500基因第一个外显子上出现单碱基替换:编码区的第47个碱基由G突变为A,导致编码的精氨酸突变为组氨酸。NCBI网站预测,Os05g0455500编码Δ1-吡咯啉-5-羧酸合成酶(Delta1-pyrroline-5-carboxylate synthetase,P5CS),基因组长6716 bp,包含19个外显子,18个内含子(图4-C),编码区(Coding sequence,CDS)长2151 bp,编码一个包含716个氨基酸残基的蛋白。根据以上结果,将OsP5CS定为FSE4的候选基因。