《表2 陆地棉DUF642基因信息》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《基于表达谱分析陆地棉DUF642基因家族抗逆功能》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

注：PM，细胞膜；Ext，细胞外；Chl，叶绿体；Cyt，细胞质；Mit，线粒体。

基于陆地棉基因组数据，通过BLAST共鉴定到23个DUF642基因。根据它们在染色体上的位置依次命名为GhDUF642-01～Gh DUF642-23（表2）。其中Gh DUF642-18基因序列不完整，故根据华中农业大学公布的陆地棉基因组信息（HAU version 1.1）对该基因序列进行了修正[22]。陆地棉DUF642家族基因开放读码框（Open reading frame，ORF）长度为612～1 245 bp，编码的蛋白含有203～414个氨基酸残基，相对分子质量介于22.10～45.15 kDa，理论等电点在4.37～9.41，不稳定指数为27.85～41.13，结构相对稳定。除GhDUF642-11外，家族其他成员都含有信号肽。除GhDUF642-23含有1个DUF642结构域外，其他家族成员都含有2个结构域。蛋白亚细胞定位预测显示，GhDUF642中有8个定位在细胞膜，6个定位在胞外，5个定位在叶绿体，2个定位在细胞质，2个定位在线粒体。