《表1 陆地棉GOXs基因家族》

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《棉花乙醇酸氧化酶(Glycolate oxidase)基因的克隆及表达分析》

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利用拟南芥5个GOX基因家族的蛋白为种子序列，对棉花基因组数据库进行BLASTP搜索得到14条候选序列。进一步采用CDD程序（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/cdd）对候选序列进行结构域组成分析，发现11条序列里有包含GOX基因家族的特有的α-羟基酸氧化-FMN域。因此，这11条序列被认为是GOX家族基因。生物信息学分析显示棉花GOX家族成员蛋白序列最长的是GH＿A09G0959，长度为414 aa；蛋白序列最短的只有365 aa，包括GH＿D10-G0605、GH＿D06G1693、GH＿A10G0573和GH＿A06-G1669四个家族成员，其家族成员蛋白序列平均长度371 aa （表1）。