《表1 陆地棉中含Cys_Met_Meta_PP结构域的基因信息》

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《棉花GhMGL11基因的克隆和表达分析》

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从Pfam数据库下载Gh MGL11蛋白保守结构域Cys_Met_Meta_PP的种子序列（Pfam ID:PF01053）。利用HMMER 3.0构建该蛋白的隐马尔科夫模型CGS.hmm（代码:hmmbuild CGS.hmm PF01053.sto）。利用构建的模型，在棉花陆地棉AD组蛋白质数据库中搜索（代码:>hmmsearch CGS.hmm NBI_Gossypium_hirsutum_v1.1.pep.fasta>CGS.out），获得候选基因31个。用SMART和Inter Pro Scan结构域预测软件，对31个蛋白序列的保守结构域进行分析，得到23个同源基因含有Cys_Met_Meta_PP保守结构域（表1）。利用MEGA7.0邻接法构建进化树，分析MGL在陆地棉中的进化关系。23个陆地棉MGL基因可分为5类，Gh MGL11（Cottongen登录号:Gh_A12G2168）与Gh MGL22基因（Cottongen登录号:Gh_D12G2347）在一个进化分支上，两者的Cys_Met_Meta_PP保守结构域位置和序列长度完全一致，两者功能相似性很高（图6）。