《表1辣椒NAC转录因子基因注释及BLAST检索Table1Gene annotation and BLASTsearch ofNACtranscription factorin pepper》
NAC转录因子保守结构域一般由约150个氨基酸组成,分为A,B,C,D和E 5个亚结构域,根据亚结构域的序列特点,拟南芥和水稻上将其NAC基因家族划分为2大类,18亚类(Hisakoa et al.,2003)。利用DNAMAN6.0软件对上述21个辣椒NAC蛋白氨基酸序列进行多序列比对分析,这21个辣椒NAC蛋白都具有典型的NAC结构域特征(图1),根据NAC转录因子5个亚结构域的序列特点可将其中18个辣椒NAC基因归类为GroupⅠ,3个NAC基因归类为GroupⅡ。比较分析2大类NAC蛋白亚结构域的序列特点发现,亚结构域A,C和D较B和E要保守。同时,GroupⅠ和GroupⅡ的亚结构域B,C和E的序列之间存在明显的差异(图1)。
图表编号 | XD0019091700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.08.28 |
作者 | 刁卫平、王述彬、刘金兵、潘宝贵、郭广君、戈伟、高长洲 |
绘制单位 | 江苏省农业科学院蔬菜研究所江苏省高校园艺作物遗传改良重点实验室、江苏省农业科学院蔬菜研究所江苏省高校园艺作物遗传改良重点实验室、江苏省农业科学院蔬菜研究所江苏省高校园艺作物遗传改良重点实验室、江苏省农业科学院蔬菜研究所江苏省高校园艺作物遗传改良重点实验室、江苏省农业科学院蔬菜研究所江苏省高校园艺作物遗传改良重点实验室、江苏省农业科学院蔬菜研究所江苏省高校园艺作物遗传改良重点实验室、江苏省农业科学院蔬菜研究所江苏省高校园艺作物遗传改良重点实验室 |
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