《表1 Chiltepin辣椒野生种的RWP-RK转录因子基因信息列表》

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《辣椒RWP-RK转录因子分析》


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以拟南芥RWP-RK转录因子家族全部成员的氨基酸序列为检索序列,Local BLAST[11]从本地全基因组氨基酸数据库中筛选出遵辣1号和Chiltepin2个辣椒品种中相似度高的蛋白质序列(E值<0.001)。(表1是野生种Chiltepin的RWP-RK转录因子信息列表,表2是遵辣1号RWP-RK转录因子信息列表)。对所得序列进行SMART(http://smart.embl-heidelberg.de/)[9]结构域分析,验证所有序列都含有RWP-RK结构域。含有RWP-RK结构域的全长基因序列进入下一步的分析。