《表2 基因注释量统计Tab.2 Statistics of annotation gene number》
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《罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)卵巢发育不同时期转录组分析》
通过与Pfam、NR、String、Swissprot、KEGG数据库比对,有52029个Unigenes与已知基因同源,占整个组装转录本的54.55%,Pfam、NR、String、Swissprot、KEGG数据库中同源序列条数分别为11308(11.86%)、16417(17.21%)、4281(4.49%)、11600(12.16%)、8423(8.83%)(表2) 。物种同源性分析表明,本研究罗氏沼虾unigenes与NR库中无脊椎动物的基因具有同源性,与NR数据库比对的16417个unigenes中,与内华达古白蚁(Zootermopsis nevadensis)同源序列比例最高,达到10.99%(1804个),其次是与淡水枝角水蚤(Daphnia pulex)的同源序列比例,达到6.62%(1087个),而与Danaus plexippus的同源序列比例最低,为0.98%(161个)(图2) 。
图表编号 | XD0034437900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.03.01 |
作者 | 陈雪峰、王春琳、顾志敏、徐宾朋、张宇飞、慎佩晶、程海华、彭菲、李喜莲、黄振远 |
绘制单位 | 宁波大学海洋学院、国家罗氏沼虾遗传育种中心浙江省淡水水产研究所、宁波大学海洋学院、国家罗氏沼虾遗传育种中心浙江省淡水水产研究所、国家罗氏沼虾遗传育种中心浙江省淡水水产研究所、国家罗氏沼虾遗传育种中心浙江省淡水水产研究所、国家罗氏沼虾遗传育种中心浙江省淡水水产研究所、国家罗氏沼虾遗传育种中心浙江省淡水水产研究所、国家罗氏沼虾遗传育种中心浙江省淡水水产研究所、国家罗氏沼虾遗传育种中心浙江省淡水水产研究所、国家罗氏沼虾遗传育种中心浙江省淡水水产研究所 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |
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