《表2 陆地棉ARF与LAV基因复制的Ka/Ks分析Table 2 Ka/Ks analysis for the ARF and LAV duplicated genes from cotton》

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《陆地棉ARF与LAV家族成员鉴定及表达模式分析》


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注:Duplicated gene pairs:复制基因对;Slient Pos:同义或沉默替代位点总数目;Slient Dif:同义或沉默替代位点差异数目;Nsyn Pos:非同义或沉默替代位点总数目;Nsyn Dif:非同义或沉默替代位点差异数目。Note:Slient Pos:The total number of silent sites;Slient Dif:The total n

根据家族成员间进化关系以及染色体定位情况,共发现17个基因对参与片段复制事件(表2),分别为Gh ARF1/3、Gh ARF6/7、Gh ARF4/5、Gh ARF9/12、Gh ARF14/27、Gh ARF16/19、Gh ARF17/18、Gh ARF20/21、Gh ARF22/24、Gh ARF/23/48、Gh ARF/29/34、Gh ARF30/31、Gh ARF/32/35、Gh ARF37/38、Gh ARF39/40、Gh ARF41/42和Gh ARF43/44。由表2可知,各对基因非同义替换速率(Ka),均低于同义替换速率(Ks),说明同义替代占优势。