《表2 直系同源基因对与Ka/Ks值》
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《双子叶植物VQ基因家族的全基因组鉴定与盐胁迫下的表达模式分析》
注:直系同源基因1列和直系同源基因2列之间无明显联系。Note:There is no obvious connection between column orthologs 1 and column orthologs 2.
拟南芥、葡萄和杨树3个物种间鉴定直系同源基因(Ortholog)时,发现拟南芥、葡萄和杨树中分别有10、1和5个未有直系同源基因。由表2分析可知,100个VQ基因的直系同源基因均来自VQ基因家族成员,而AtVQ3、At VQ10、VvVQ3、VvVQ4、VvVQ9、PtVQ3、PtVQ12、PtVQ14和Pt VQ35 9个VQ成员的直系同源基因中有来自非VQ基因家族的基因。拟南芥和杨树之间的直系同源基因对较多,共40对;拟南芥和葡萄之间的直系同源基因对达15对;杨树和葡萄之间的直系同源基因对为40对。VvVQ12与杨树VQ基因的直系同源对最多(6对),分别是VvVQ12-PtVQ40、Vv VQ12-Pt VQ2、VvVQ12-PtVQ36、VvVQ12-PtVQ51、VvVQ12-PtVQ49和VvVQ12-PtVQ15。统计所有直系同源对之间的Ka/Ks比值,发现Ka/Ks比值范围在0.008~0.700,均小于1,表明VQ基因的进化受纯化选择作用。
图表编号 | XD00841600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.09.30 |
作者 | 严涵薇、陈风、潘枫、项艳 |
绘制单位 | 安徽农业大学林学与园林学院、安徽农业大学林学与园林学院、安徽农业大学林学与园林学院、安徽农业大学林学与园林学院 |
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