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第1章 绪论1

1.1 生物分子和生物有机化学1

1.2 生物大分子2

1. 生物大分子的官能团以及它们之间的相互作用2

2. 生物大分子的立体结构3

3. 构成生物大分子的基本结构单元4

1.3 生物体内发生基本生物有机化学反应类型6

1.4 生物有机化学中的立体效应8

1. 对生物分子反应活性的影响--邻基效应9

2. 对反应立体选择性的影响9

3. 生物分子的相互作用和生物超分子13

第2章 氨基酸和多肽的生物有机化学18

2.1 蛋白质、多肽和氨基酸18

2.2 氨基酸18

1. ɑ-氨基酸的结构18

2. ɑ-氨基酸的离解性质19

3. 氨基酸的侧链性质--ɑ-氨基酸的分类21

4. 氨基酸的重要反应25

2.3 肽键和多肽29

1. 肽键30

2. 多肽30

2.4 蛋白质的结构31

1. 蛋白质的一级结构31

2. 蛋白质的三维结构31

2.5 多肽结构分析中的化学反应33

1. 多肽链的选择性水解33

2. 多肽端基氨基酸分析法35

2.6 多肽链的反应38

1. 多肽侧链的反应38

2. 多肽链中氨基酸的邻基反应40

3. 多肽主链的反应和消旋化40

2.7 氨基酸的化学合成41

1. ɑ-氨基酸经典化学合成法41

2. ɑ-氨基酸的不对称合成法44

2.8 多肽的化学合成50

1. 氨基的保护方法51

2. 羧基的保护方法53

3. 肽键形成的方法54

4. 多肽合成的策略58

5. 多肽的固相合成59

6. 组合合成法合成多肽60

2.9 分子识别在蛋白质化学中的意义62

1. 具有分子识别功能的药物分子的设计63

2. 分子识别理论与亲和色谱技术67

第3章 核酸的生物有机化学68

3.1 核酸和生命遗传的化学本质68

3.2 核酸(DNA和RNA)的结构68

1. 构成DNA和RNA的结构单元分子68

2. 多聚核苷酸70

3. DNA的结构71

4. RNA的结构和分类73

3.3 嘌呤碱基和嘧啶碱基的性质和重要的化学反应74

1. 碱基环的芳香性和互变异构74

2. 碱基的碱性76

3. 嘌呤和嘧啶碱基的化学反应76

3.4 核酸的性质82

1. 核酸的离解性质82

2. 核酸的水解82

3.5 核酸碱基顺序分析中的化学反应84

1. Maxam-Gilbert 碱基顺序分析法84

2. Sanger碱基顺序分析法88

3. RNA的碱基顺序分析法89

3.6 核苷酸89

1. ATP和GTP89

2. cAMP和cGMP92

3.7 多聚核苷酸的生物合成93

1. DNA的生物合成93

2. RNA的生物合成93

3.8 多聚核苷酸的化学合成94

1. 保护基94

2. 磷酸酯键的形成103

3. DNA的固相合成法106

3.9 核酸和蛋白质的合成108

1. 氨基酸的活化108

2. 蛋白质的合成111

3.10 核酸化学中的几种重要新技术112

1. DNA重组技术和基因工程112

2. PCR技术114

3. 基因定点突变技术116

4. 定向分子进化117

第4章 酶的生物有机化学119

4.1 酶是生物催化剂119

1. 酶的催化作用特性119

2. 与酶的催化特性有关的因素121

4.2 酶的非蛋白组分--辅酶和金属离子126

1. 辅酶127

2. 酶分子中的金属离子128

4.3 酶的催化作用机制128

1. 催化作用128

2. 酶催化反应机制类型129

4.4 丝氨酸蛋白酶水解机制135

1. 水解作用的动力学模型135

2. 酶活性中心重要催化活性基团的测定136

3. 催化作用机制138

4.5 酶催化活性的调控和酶的抑制作用141

1. 酶催化活性的生物学调控141

2. 酶活性的化学调控和抑制剂143

4.6 酶的作用机制与生物活性分子的设计144

1. 酶的结构及其作用机制是设计生物活性分子的基础144

2. 具有抗β-内酰胺水解酶的青霉素145

3. 具有抗癌活性的生物还原烷基化剂147

4. 降高血压新药--血管紧张肽转化酶抑制剂149

4.7 非蛋白生物催化剂--核酸酶151

1. 核酸酶的发现152

2. 核酸酶制备的新途径153

3. 核酸酶的催化性质153

4.8 抗体酶和杂化酶153

1. 抗体酶153

2. 杂化酶158

4.9 酶模型162

1. 酯键水解酶模型163

2. 酰胺键水解酶模型165

3. 环糊精酶模型166

第5章 酶促有机化学反应及其应用168

5.1 酶和酶促有机化学反应168

1. 酶促有机化学反应的特点168

2. 酶促有机化学反应的应用前景169

3. 酶制剂的选择和修饰169

5.2 酶催化的水解反应171

1. 酶催化水解反应机制171

2. 酶催化水解反应的立体选择性及其在对映体拆分中的应用172

3. 水解酶的类型172

4. 提高酶选择性的方法173

5. 酶催化的酯水解反应173

6. 酶催化的肽键水解反应177

7. 酶催化的糖苷键水解反应177

8. 酶催化的环氧化物水解反应179

9. 酶催化的腈水解反应180

5.3 酶催化的氧化还原反应181

1. 氧化还原反应和氧化还原酶182

2. 脱氢酶催化的醇脱氢反应184

3. 脱氢酶催化的烃基脱氢反应186

4. 加氧酶催化的氧化反应186

5. 脱氢酶催化的醛和酮还原反应190

6. 脱氢酶催化的C?C双键还原反应193

5.4 酶催化的碳-碳键形成反应195

1. 醛缩酶催化的缩合反应及其机制195

2. 酶催化非天然底物的醇醛缩合反应197

5.5 酶催化的加成反应200

1. 酶催化的C?C双键加成反应200

2. 酶催化的羰基加成反应201

5.6 酶催化的卤化反应和脱卤素反应202

1. 酶催化的卤化反应202

2. 酶催化的脱卤素反应203

5.7 有机介质中的酶促有机化学反应205

1. 有机溶剂中的酶学性质205

2. 酶促反应的有机溶剂体系206

3. 有机介质中酶催化的酯化反应207

4. 有机介质中酶催化的酰胺键形成反应210

5. 有机介质中酶催化的过氧酸形成反应211

6. 有机介质中酶催化的氧化还原反应211

7. 有机介质中酶催化的糖苷键形成反应212

主要参考文献214

索引215

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