《表3 条带回收序列比对结果》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《金沙土遗址土壤细菌群落结构和推测的代谢特征》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

电泳结束后，对主条带进行切胶回收，克隆测序后，共获得21条序列，所有序列与NCBI数据库中已知序列相似性均在98%-100%之间（表3）。结果如表3所示，土遗址样品中的细菌分属4个门：放线菌门（Actinobacteria）、酸杆菌门（Acidobacteria）、异常球菌-栖热菌门（Deinococcus-Thermus）、变形菌门（Proteobacteria）；7个属分别为红色杆菌属（Rubrobacter）、北里孢菌属（Kitasatospora）、短状杆菌属（Brachybacterium）、Tellurimicrobium、异常球菌属（Deinococcus）、伯克氏菌属（Burkholderia）、短波单胞菌属（Brevundimonas），以上7个属的细菌在DNA水平上均有检出，而伯克氏菌属、Tellurimicrobium和Uncultured Burkholderiales bacterium没有在RNA水平上检出。此外，在DNA水平上，红色杆菌属、异常球菌属、短波单胞菌属细菌在所有供试样品中均有检出，短状杆菌属细菌仅在J2和J3样品中检出，Tellurimicrobium仅在J2样品中检出；伯克氏菌属细菌仅在J3样品中检出。在RNA水平上，红色杆菌属和短波单胞菌属细菌也在所有供试样品中均有检出，北里孢菌属细菌仅在J3样品中检出，短状杆菌属细菌仅在J2样品中检出。回收的21条序列有11条归属于红色杆菌属，占回收序列的52.83%，且在劣化样品中检出较多（图5，表3）。结果表明，不同样品中细菌种群组成的差异可能与其劣化状态和劣化程度不同有关，而在RNA水平检测出的菌属值得关注。