《表1 12条回收序列Green Gene数据库比对》

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《DGGE揭示红壤稻田以产甲烷菌为主的稳定古菌群落结构特征》

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用PCR-DGGE技术对所采集的古菌群落结构进行检测，发现样品中共计检测到16条条带（图2），编为A1~A16，经割胶、扩增，测出了其中12条条带的DNA序列（表1）。在Greengenes数据库对序列进行比对后，确定这12条序列中，有8条属于广古菌门（Euryarchaeota），4条属于泉古菌门（Crenarchaeota）。8条属于广古菌门的序列中有6条属于产甲烷菌（Methanomicrobia），而其中5条都属于甲烷八迭球菌目（Methanosarcinales），4条属于泉古菌门中的序列有1条属于亚硝化古菌种（Nitrosotalea）。使用Quantity-One对DGGE图谱进行灰度分析后，以九月样品为例，发现产甲烷菌为最优势菌类群，其丰度占所有古菌的49.15%，其中优势目甲烷八迭球菌目占39.45%，而亚硝化古菌占所有古菌的6.07%（表1）。九月份土壤古菌的香农多样性指数为（2.41±0.15）。