《表2 TGGE凝胶切胶回收条带序列与GeneBank中最相近菌种的序列BLAST比对结果》
TGGE图谱中16个条带(15个细菌条带和1个古菌条带)进行了切胶、纯化、PCR扩增及测序,结果12个条带测序成功。本研究中所得的序列均已提交至GenBank数据库,登录号为MK182943-MK182954。获得的序列分别在GeneBank数据库中进行BLAST同源性比对,比对结果见表2。结果表明所有的条带序列与GeneBank中已公布的菌种序列的相似性为90%~100%,相似性的菌株都来源于海水、含盐废水、海滩、盐湖等高盐环境。细菌主要为γ-Proteobacteria、α-Proteobacteria和Actinobacteria三大类,其中优势菌为γ-Proteobacteria,1号和14号条带的优势菌皆为Spiribacter salinus,2号和15号条带的优势菌皆为Pseudoalteromonas sp.,16号条带的优势古菌为Halogeometricum sp.,相似性高达99%。采用NJ法构建条带序列的系统进化树如图2所示,表明多数条带序列属于变形菌门,主要包括α-Proteobacteria(5个条带)和γ-Proteobacteria(4个条带),少数条带序列属于放线菌门Actinomycetales(1个条带)。1个古菌条带鉴定为广古菌门(Euryarchaeota)几何菌属(Halogeometricum sp.)菌株。
图表编号 | XD0089704300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.05.15 |
作者 | 秦乐宁、黄鑫洁、朱大玲、侍亚敏、唐娜、王学魁 |
绘制单位 | 天津市卤水化工与资源生态化利用重点实验室化工与材料学院天津科技大学、天津市卤水化工与资源生态化利用重点实验室化工与材料学院天津科技大学、天津市卤水化工与资源生态化利用重点实验室化工与材料学院天津科技大学、天津市卤水化工与资源生态化利用重点实验室化工与材料学院天津科技大学、天津市卤水化工与资源生态化利用重点实验室化工与材料学院天津科技大学、天津市卤水化工与资源生态化利用重点实验室化工与材料学院天津科技大学 |
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