《表2 TGGE凝胶切胶回收条带序列与GeneBank中最相近菌种的序列BLAST比对结果》

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TGGE图谱中16个条带(15个细菌条带和1个古菌条带)进行了切胶、纯化、PCR扩增及测序,结果12个条带测序成功。本研究中所得的序列均已提交至GenBank数据库,登录号为MK182943-MK182954。获得的序列分别在GeneBank数据库中进行BLAST同源性比对,比对结果见表2。结果表明所有的条带序列与GeneBank中已公布的菌种序列的相似性为90%~100%,相似性的菌株都来源于海水、含盐废水、海滩、盐湖等高盐环境。细菌主要为γ-Proteobacteria、α-Proteobacteria和Actinobacteria三大类,其中优势菌为γ-Proteobacteria,1号和14号条带的优势菌皆为Spiribacter salinus,2号和15号条带的优势菌皆为Pseudoalteromonas sp.,16号条带的优势古菌为Halogeometricum sp.,相似性高达99%。采用NJ法构建条带序列的系统进化树如图2所示,表明多数条带序列属于变形菌门,主要包括α-Proteobacteria(5个条带)和γ-Proteobacteria(4个条带),少数条带序列属于放线菌门Actinomycetales(1个条带)。1个古菌条带鉴定为广古菌门(Euryarchaeota)几何菌属(Halogeometricum sp.)菌株。