《表1 Sarcophyton的msh1基因部分序列的blast比对结果》

《表1 Sarcophyton的msh1基因部分序列的blast比对结果》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《海南肉芝软珊瑚msh1基因的系统进化》


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选取737个碱基长度的msh1基因序列,海南32份肉芝软珊瑚(Sarcophyton)msh1基因序列经序列比对去除msh1基因序列相同的样本后,22份海南样本与已知Sarcophyton种构建了msh1基因序列进化树.在序列比对中发现,海南样本msh-11在序列717位置缺失单碱基;样本msh-50在序列632和652的位置分别插入单碱基T;其余样本与已知Sarcophyton种未见碱基插入和缺失.从图2中可以看出,样本msh-5与Sarcophyton cinereum和Sarcophyton crassocaule序列相同;样本Msh-6与Sarcophyton cherbonnieri亲缘关系最近.样本msh-21和msh-17与Sarcophyton buitendijki亲缘关系最近.样本msh-44与Sarcophyton boettgeri和Sarcophyton digitatum亲缘关系最近;样本msh-30和Msh-38与Sarcophyton ehrenbergi和Sarcophyton mililatensis亲缘关系最近;其中:样本msh-8、msh-7、msh-12、msh-5、msh-9和msh-40与其他Sarcophyton亲缘关系较远,选取了样本msh-12和msh-40的msh1基因序列进行了blast比对(见表1),结果表明,这2个样本均比对到Sinularia属,文献[10]也有类似的报道,这些是否是新种有待进一步确定.