《表2 部分氨氧化细菌amoA基因OTUs序列比对结果》

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《科尔沁沙地小叶锦鸡儿群落土壤氨氧化细菌多样性》

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如图1所示，所有的amoA序列都属于基于β-变形菌纲（β-proteobacterium）的亚硝化螺菌属（Nitrosospira），未发现属于亚硝化单胞菌属的序列（Nitrosomonas）。所有属于Nitrosospira的序列可以分为cluster 3a.1、cluster 3a.2、cluster 3b、cluster 9、cluster 10共5个簇，其中cluster 3a.1占有最多的OTU，其次为cluster 9。Cluster 3a.1的OTU01和cluster 9的OTU04在9个文库中都存在；而cluster10中的OTU07和OTU31，仅能在MS样地中发现；Cluster 3b（只包含OTU15和OTU26）只存在于NCM和CMP样地中，未在MS中发现。OTU01、04、07、31、15、26的Genebank序列比对结果如表2所示。图2显示了各个样地中每个cluster所包含OTU数占总OTU的比例，即相对优势度。相对优势度最高的cluster 3a.1在MS、NCM和CMP三个样地中的比例分别占38.75%、62.79%和48.71%，而cluster 9的比例分别为32.5%、35.7%和42.8%。