《表3 DGGE条带细菌16SrDNA部分基因序列比对分析》

《表3 DGGE条带细菌16SrDNA部分基因序列比对分析》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《基于PCR-DGGE技术对糍粑辣椒腐败过程细菌多样性动态研究》


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采用2次重复检测验证每个取样点条带的方式,结果显示DGGE图谱皆无明显差异。DGGE图谱上条带的多少和亮度分别代表微生物种类的多少和数量的多少[23],条带越多说明样品的菌种种类越丰富,条带越粗亮说明该种微生物数量多,占优势。图谱上不同迁移位置条带代表着不同种类的微生物,相同的迁移位置代表着相同的条带,同种微生物迁移位置相同,即为相同条带,反之,则称为差异性条带[24]。由DGGE图可以看出,在0~7d糍粑辣椒贮藏动态监测过程中,检测出较多条带,也都比较亮,表明糍粑辣椒中微生物多样性较高,优势菌较突出。将DGGE图谱上不同的条带进行割胶、DNA回收、测序,登录NCBI网站在Blast软件中的GenBank数据库里进行序列比对,其分析结果见表3,条带8,12分别为潘氏泛酸菌株(Pantoea cypripedii)、非培养的罗思河小杆菌属(Uncultured Rhodanobactersp.),相似性为93%、92%,其余条带检测出的细菌相似性则均达95%以上,其中,条带10,14分别为葱属洋葱菌(Allium cepa)、阿里谷氨酸杆菌(Glutamicibacter arilaitensis),其相似性高达100%。