《表2 氨氧化细菌和氨氧化古菌扩增引物》

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《紫色土N_2O排放及氨氧化微生物群落结构对玉米秸秆与化肥减量配施的响应》


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克隆文库:选用不同的引物对土壤AOA和AOB amoA基因进行扩增(引物见表2).利用DNA纯化回收试剂盒(Universal DNA Purification Kit,TIANGEN)对扩增PCR产物进行纯化,纯化产物通过pGEM-T载体(Promega Corp,USA)进行克隆.根据“蓝白斑”(抑制剂:0.2%X-Gal,0.1%Amp,0.05%IPTG)对克隆子进行初步筛选,再通过菌液PCR扩增(体系25μL)电泳筛选后,选出目的大小片段的克隆,每个处理选择30个克隆子送至生工生物有限公司进行序列测定.利用Muthur软件将测序成功的结果进行序列分析,筛选核糖酸序列相似度>97%序列,将其视为同一个可操作分类单元(operational taxonomic units,OTU).将代表基因序列提交NCBI(National Center for Biotechnology Information)以获取基因登录号.AOA和AOB amoA基因登录号分别为:MH200776-MH200817,MH200739-MH200775.