《表1 氨氧化微生物amo A基因引物信息和荧光定量PCR扩增条件Tab.1 Primers of archaeal and bacterial amo A gene and q PCR condit

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《嘉陵江(南充段)水体及其底泥中氨氧化微生物群落空间分布特征及其与环境因子关系》

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每个采样点取500 ml水样，采用0.22 um的滤膜过滤，保留滤膜置于-20℃保存，用于DNA的提取。底泥称取0.5 g底泥用于提取DNA。DNA提取采用Fast DNASpin Kit for Soil（MP Biomedicals company），按照试剂盒说明进行样品DNA提取。提取的DNA分别用凝胶电仪成像和Nano Drop浓度测定（Nano Drop Technologies，Wilmington，Germany）等两种方法评估DNA提取质量。AOA和AOB的amo A基因和总细菌16S rRNA基因引物信息列于表1中。标线是含有相应amo A基因和16S rRNA基因的质粒，质粒浓度分别稀释6个梯度（102~107），采用SYBR Green法，在BIO-RAD CFX96型实时荧光定量PCR仪进行定量分析。扩增效率为95%~102%之间，R2值在0.991~0.996之间。荧光定量PCR的运行条件如表1中所示。