《表3 反向文库部分BLAST比对结果》
从正反向文库中各挑选600个阳性克隆,共1 200个进行测序,分别获得574条(正向文库)和595条(反向文库)高质量表达序列标签(expressed sequence tags,ESTs)序列,平均长度分别为207.5 bp和242.7 bp。进一步拼接后获得632条unigenes,正反向文库分别为178条和454条。将获得的632条unigenes与公共数据库进行BLAST比对处理,将e值设置为e≤1E-5,结果有147条序列被注释成功,其中80条是已知功能基因,67条是未知功能基因,此外还发现了485条新基因(表1)。BLAST比对结果表明,632条unigenes大多与百脉根基因组DNA上1至6号染色体上的基因具有同源性。在这147条基因中,发现了参与转录过程的多聚蛋白(polyprotein,Pol)、依赖性ATP螺旋酶MPNU_020和核糖核酸酶H等;参与蛋白质合成的核糖体RNA基因;参与物质代谢的线粒体基因Orf116d;参与催化作用的gag-pol聚合酶和Maturase成熟酶;参与糖代谢的甘露糖-4,6-脱水酶和β-半乳糖苷酶;影响植物光合作用的叶绿体基因和Ycf2基因;与植物抗旱有关的丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶、吲哚-3-乙酸诱导蛋白ARG7、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)和类钙调素蛋白(calmodulin-like protein,CML)等(表2;表3),说明B08百脉根在遭受干旱胁迫后部分抗旱相关基因产生了差异性表达。
图表编号 | XD00109952600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.12.25 |
作者 | 简忠领、赵丽丽、王普昶、孙小富、陈超 |
绘制单位 | 贵州大学动物科学学院、贵州大学动物科学学院、贵州省草业研究所、贵州大学动物科学学院、贵州大学动物科学学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |