《表1 本研究中所用的引物及重组载体信息》

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《杨扇舟蛾颗粒体病毒经口侵染因子PIF0~PIF6间分子互作的酵母双杂交验证》


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上游引物(F)中包含Nde I的酶切位点CATATG,下游引物(R)中包含Pst I的酶切位点CTGCAG。Upstream primers(F)contain the cleavage site CATATG(Nde I);downstream primers(R)contain the cleavage site CTGCAG(Pst I).

取4层纱布过滤ClanGV侵染致死的液化虫尸,差速离心纯化多角体,采用碱裂解法提取病毒基因组并作为模板。根据NCBI注册的ClanGV基因组序列(NC_015398),分析目的基因pif1(orf61)、pif2(orf23)、pif3(orf33)、pif4(orf74)、pif5(orf15)、pif6(orf98)的序列,利用丹麦科技大学CBS服务器上的TMHMM Server 2.0程序(http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM)进行蛋白序列的跨膜区分析。根据跨膜区的分析结果以及酵母表达载体PGADT7和PGBKT7的特点,设计相应引物进行目的基因的扩增(表1)。25μL PCR反应体系均为:2×Taq PCR Green Mix 12.5μL、DNA模板1.0μL、10μmol/L Primer F 0.5μL、10μmol/L Primer R 0.5μL、ddH2O10.5μL。扩增程序:94℃预变性3 min;94℃变性30 s,52℃(pif1、pif2、pif4扩增引物)或50℃(pif3、pif5、pif6扩增引物)退火30 s,72℃延伸(pif1、pif2、pif5扩增引物延伸2 min,pif3、pif4、pif6扩增引物延伸1 min),30个循环;72℃总延伸5 min。利用1%琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物。