《表5 角果长度关联位点候选基因信息》

《表5 角果长度关联位点候选基因信息》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《甘蓝型油菜角果长度性状的全基因组关联分析》


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基于中双11号基因组注释信息,在Bn-A09-p29991443位点下游153 kb和184 kb处分别找到油菜角果长度已知基因ARF18和BnaA9.CYP78A9(表5)。ARF18编码一个生长素响应因子,通过生长素信号途径调节角果皮的细胞生长[24]。BnaA9.CYP78A9编码一个细胞色素P450单加氧酶,通过调节细胞的伸长影响角果长度[25]。基于Darmor-bzh基因组注释信息,在Bn-A09-p3051349位点上游252 kb处找到一个候选基因BnaA09g05500,该基因的拟南芥同源基因FUL编码一个MADS-box转录因子,该基因突变导致植株角果无法伸长,果实不能正常开裂[26]。在Bn-scaff_20817_1-p60579位点上游293 kb处找到一个候选基因Bna C04g50960,该基因的拟南芥同源基因EOD3编码一个细胞色素P450单加氧酶,其功能缺失突变体角果长度缩短、种子变小[27]。在Bn-scaff_16069_1-p1668600位点下游490 kb处找到一个候选基因BnaC07g36530该基因在拟南芥中的同源基因DOF4.4属于Dof转录因子家族,RNAi株系角果增长、产量增多[28]。此外,本研究还找到别的候选基因,如拟南芥已知基因GID1b和ga20ox1在油菜中的同源拷贝[29-30]。