《表3 MLM角果长度显著关联位点 (BLUP)》

《表3 MLM角果长度显著关联位点 (BLUP)》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《甘蓝型油菜角果长度性状的全基因组关联分析》


  1. 获取 高清版本忘记账户?点击这里登录
  1. 下载图表忘记账户?点击这里登录

利用MLM模型,当阈值为-lg(P)=4.28时,检测到15个显著SNP。合并存在连锁不平衡的SNP(r2≥0.1),得到7个显著位点,分布在A07、A09、C02、C04和C09染色体(表3和图2)。效应最大的位点Bn-A09-p29991443位于A09染色体[-lg(P)=13.59],对表型变异的贡献率为13.89%;携带其等位基因型A的材料(48份)角果长度均值为6.62 cm,比携带基因型T的材料(389份)角果长度均值增加0.89 cm。商品种如华油6号、华油12号、中双5号、中双7号、中双11号、宁油6号、湘油13号等,地方品种包括南川长角、湖北白花油菜等均携带该位点的优异等位基因型(附表2)。其余位点的-lg(P)值范围是4.29~5.80,可解释3.21%~5.10%的表型变异。利用一般线性模型计算,7个位点联合解释25.01%的表型变异。与单环境的关联结果比较,5个BLUP位点在单环境中被重复检测到,3个位点在2个环境中得到验证,Bn-A09-p29991443位点在3个环境中被重复检测到。