《表2 Q426菌株组氨酸激酶的结构域功能》

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《解淀粉芽孢杆菌Q426双组分信号转导系统的生物信息学分析》

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大部分的HKs是有个多结构域且能够形成同型二聚体的跨膜蛋白[12]，HK的N-端存在多个跨膜区，不同结构域分布其中，使HK的结构和功能具有多样性；HK的C-端区域有多个ATP结合位点，典型的HK有HATPase＿c和His KA结构域，HAT-Pase＿c结构域位于胞内，包含4个保守的N、D、F和G-Box，是组氨酸激酶的催化结构域，主要负责把ATP的磷酸基团转移到His KA结构域的组氨酸残基上。His KA是磷酸受体结构域，该区域含有一个保守组氨酸位点的H-box，能够自身磷酸化[13]。从Pfam数据库中得知，目前已发现的结构域超过19 000种，因为结构域是一种介于二级和三级结构之间的一种结构层次，所以不同结构域组合的蛋白质表达不同的功能，比如:DegS结构域与细胞生长周期的调控有关，含有该结构域的HK可能参与调控细胞生长周期。在Q426菌株中找出的42个HKs含HAMP、PAS、PAC、s Cache＿like、7TMR-DISM＿7TM、REC、Cache＿3、SPOB＿a、HSP90、GAF、HPT、MutL＿C、PDZ等25种结构域，其中保守性高的HisKA和HATPase＿c是所有HKs必需的结构域，它们是磷酸基团传递的重要基础。这25种结构域的功能如表2所示。其中，19个成对的HK包含11种结构域，这19个HK的结构域组成如图1所示（图中左列数字是HK在基因组数据中的编号，右侧是HK的结构域组合）。