《表2 鲨烯环氧酶蛋白功能结构域预测》

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《野三七鲨烯环氧酶基因的克隆及原核表达》

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利用在线软件ExPASy-ProtParam tool对PvfSE基因编码蛋白质的理化性质进行分析，结果显示PvfSE蛋白质由628个氨基酸组成，分子式为C3078H4895N849O885S28，相对分子质量为68.852 kDa，理论等电点（PI）为9.28，带负电残基（Asp+Glu）为52，带正电残基（Arg+Lys）为70，不稳定系数为40.70，属于不稳定蛋白。脂肪系数（AI）为89.32，亲水性系数（GRAVY）为-0.118。利用Protscale在线软件对PvfSE蛋白质的疏水性进行分析（图2），该蛋白质大约在94～115 aa和159～175 aa有2个典型的疏水区域。用TMHMM2.0预测跨膜区，结果显示（图3），PvfSE蛋白的1～93 aa位于膜表面，117～160 aa位于膜内，94～116 aa和161～178 aa形成两个典型的跨膜螺旋区，与该蛋白质的疏水性区域分析结果基本一致。信号肽分析表明无信号肽。用TargetP1.1 Server进行亚细胞定位预测，结果显示Pvf SE蛋白可能定位于叶绿体。WoLF PSORT预测结果为plas 5，chlo 3，vacu 2，E.R.2，nucl 1，mito 1。因此，PvfSE蛋白可能定位于细胞质膜及叶绿体。用InterPro预测PvfSE的结构域（表2），PvfSE蛋白在310～582 aa处含有鲨烯环氧酶结构域。