《表2 CAD1编码蛋白的结构域预测》
结构域是在蛋白质三级结构中介于二级和三级结构之间的可以明显区分但又相对独立的折叠单元,每个结构域自身形成紧实的三维结构,可以独立存在或折叠[15]。将CAD1基因的氨基酸序列提交到NCBI数据库中的Conserved Domains中。预测得到4个相关结构,结果如表2所示,得到的结果在PROSITE中生成图像如图9所示。其中,bZIP_YAP为酵母活化蛋白(YAP)和类似蛋白质的基本亮氨酸拉链(b ZIP)结构域;BRLZ为基本区域亮氨酸拉链的结构域;PAP1为转录因子Pap1调节抗氧化剂基因转录以响应H2O2,该区域富含半胱氨酸,用半胱氨酸烷化剂处理后半胱氨酸残基的烷基化可掩盖核输出蛋白Crm1的可及性,引发核积累和Pap1依赖性转录表达[22];bZIP_1为bZIP转录因子Pfam条目包括基本区域和亮氨酸拉链区域的结构域。
图表编号 | XD00123299200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.01.01 |
作者 | 吴杰新、刘小珍、叶琴霞、张汉尧 |
绘制单位 | 西南林业大学西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室、西南林业大学西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室、西南林业大学西南山地森林资源保育与利用教育部重点实验室、西南林业大学西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室 |
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