《表2 VvWRKY蛋白的WRKY结构域中WRKY七肽域和锌指结构的变异》

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《葡萄全基因组WRKY转录因子鉴定和分析》


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分别利用序列分析软件(DNAMAN V6)和在线软件WebLogo 3(http://weblogo.threeplusone.com/)分析VvWRKY蛋白的结构域。结果表明,VvWRKY家族WRKY结构域是高度保守的(图3)。其中,类型Ⅰ的七肽域是WRKYGQK,锌指结构包括CX4CX22HXH和CX4CX23H XH(VvWRKY11和VvWRKY34);类型Ⅱ的a、b、d、e亚组的七肽域和锌指结构分别是WRKYGQK和CX5CX23HXH,类型Ⅱ-c亚组的七肽域包括WRKYGQK和WRKYGKK两种形式,锌指结构为CX4CX23HXH;类型Ⅲ的七肽域和锌指结构是分别是WRKYGQK和CX7C23HXC。但是,WRKY结构域中WRKY七肽域和锌指结构存在部分变异,其中类型Ⅱ-c亚组中的VvWRKY8/14/15/22基因的WRKY七肽域变异为WRKYGKK,类型Ⅰ的VvWRKY11/34和类型Ⅲ的VvWRKY7/28/39/40/46/50的锌指结构变异为CX4CX23HXH和CX7CX23HXC(表2)。