《表3 9种WRKY12蛋白的二级结构预测》

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《中间锦鸡儿WRKY12基因克隆与生物信息学分析》

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基因编码的蛋白质通常需形成三级或三级以上的空间结构而行使功能。对蛋白质结构的预测和分析有助于理解蛋白质的功能。本研究通过SWISS-MODEL对这9个不同物种WRKY12转录因子的进行三维结构同源建模（曹先爽等，2018；柳金华等，2019）（图6）。这9种不同物种的转录因子WRKY12的结构相似，都有5个β折叠平行排列。这与其一级结构（图3）中WRKY保守结构域相似性较高相关，因此其在二级结构中β折叠的占比都在20%左右（表3），预示着在三级结构上具有较高的相似性。与无规则卷曲相比，α螺旋和β折叠相对较稳定，无规则卷曲占比高通常会影响蛋白质分子空间结构的相对稳定。本研究中9个物种的无规则卷曲占比均较高，达到50%以上（表3），所以大部分预测为不稳定蛋白（只有Dz WRKY12预测为稳定蛋白）。该预测结果为后续WRKY12蛋白的功能研究提供了一定的理论依据。