《表3 高山美利奴羊INHA基因不同基因型蛋白质二级结构预测》
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《高山美利奴羊INHA基因多态性生物信息学分析及与产羔数关联分析》
利用RNA二级结构在线设计软件RNAfold预测高山美利奴羊INHA基因多态位点不同基因型的RNA二级结构,Exon1-T206A、Exon2-T387A、Exon2-G900A的位点突变均导致最小自由能和RNA二级结构的改变,从而可能造成蛋白质的结构与功能的改变(图1)。利用NPSA中的MLRC程序在线预测INHA基因外显子不同基因型的蛋白质二级结构,结果显示,Exon1-T206A错义突变位点使其蛋白质二级结构中α螺旋增加,无规则卷曲和扩展链减少,同义突变不改变蛋白质二级结构(表3)。利用蛋白质三级结构在线预测软件SWISS-MODEL对参考序列和Exon1-T206A位点突变后蛋白质的三级结构进行分析,结果显示Exon1-T206A位点的变异导致INHA基因的三级结构发生明显的改变(图2)。
图表编号 | XD00156611300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.03.25 |
作者 | 陈来运、袁超、郭健、孙晓萍、刘建斌、牛春娥、杨博辉 |
绘制单位 | 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所中国农业科学院羊育种工程技术研究中心、中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所中国农业科学院羊育种工程技术研究中心、中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所中国农业科学院羊育种工程技术研究中心、中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所中国农业科学院羊育种工程技术研究中心、中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所中国农业科学院羊育种工程技术研究中心、中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所中国农业科学院羊育种工程技术研究中心、中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所中国农业科学院羊育种工程技术研究中心 |
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