《表3 高山美利奴羊INHA基因不同基因型蛋白质二级结构预测》

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《高山美利奴羊INHA基因多态性生物信息学分析及与产羔数关联分析》


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利用RNA二级结构在线设计软件RNAfold预测高山美利奴羊INHA基因多态位点不同基因型的RNA二级结构,Exon1-T206A、Exon2-T387A、Exon2-G900A的位点突变均导致最小自由能和RNA二级结构的改变,从而可能造成蛋白质的结构与功能的改变(图1)。利用NPSA中的MLRC程序在线预测INHA基因外显子不同基因型的蛋白质二级结构,结果显示,Exon1-T206A错义突变位点使其蛋白质二级结构中α螺旋增加,无规则卷曲和扩展链减少,同义突变不改变蛋白质二级结构(表3)。利用蛋白质三级结构在线预测软件SWISS-MODEL对参考序列和Exon1-T206A位点突变后蛋白质的三级结构进行分析,结果显示Exon1-T206A位点的变异导致INHA基因的三级结构发生明显的改变(图2)。