《表3 牦牛DQA2基因SNP突变前后mRNA二级结构自由能和蛋白质二级结构》

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《牦牛DQA2基因单核苷酸多态性及其生物信息学分析》

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利用RNAfold和NPS在线软件预测牦牛DQA2基因各SNP突变前后的mRNA二级结构和蛋白质二级结构，结果分别见图3和表3：位点g.4374A>C、g.5527A>G、g.5576G>C和g.5606G>A的m RNA二级结构与突变前差异较大；8个SNP位点（g.4296A>G、g.4374A>C、g.5127C>A、g.5187C>T、g.5527A>G、g.5576G>C、g.5602C>T和g.5659C>T）的m RNA二级结构自由能有所降低，这些SNP位点均增大了牦牛DQA2基因的稳定性；而4个SNP位点（g.5103G>A、g.5137T>C、g.5141G>A和g.5606G>A）的mRNA二级结构自由能有所增大，表明这4个位点均降低了牦牛DQA2基因的稳定性；仅有1个SNP位点（g.5666C>A）的mRNA二级结构自由能与突变前相同，说明该位点对牦牛DQA2基因的稳定性没有影响。所有错义突变均使得DQA2蛋白质二级结构发生改变，突变前后二级结构各组分中无规则卷曲所占比例最高，其次为延伸链，β-转角所占比例最低。