《表3 人ATG8同源蛋白二级结构预测》

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《自噬标志分子ATG8同源蛋白的生物信息》

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本研究分析提取了NCBI的Protein数据库中登陆的酵母、线虫等模式生物的ATG8同源蛋白相关信息（表2）。虽然人的6个ATG8同源基因的大小差别很大，但是人与本研究所涉及的其他10种模式生物的ATG8同源蛋白氨基酸个数均是120个左右，说明其在物种间具有较高的保守性。随后，使用在线软件PHDhtm软件对6个人ATG8同源蛋白的二级结构进行预测（表3）。结果表明，人ATG8同源蛋白的主要二级结构是α-螺旋、不规则卷曲和延伸链3种。在LC3A和LC3C中，不规则卷曲所占比例较大，螺旋次之，延伸链比例较少，LC3B中延伸链比例较大，不规则卷曲所占比例次之，螺旋较少。在GABARAPL1和GABARAPL2中，不规则卷曲所占比例较大，延伸链比例次之，螺旋比例较少，GABARAP中螺旋比例较大，不规则卷曲所占比例次之，延伸链较少。