《表5 BSV-YN ORFⅠ蛋白及同源物的二级结构预测》

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《香蕉条斑病毒ORF Ⅰ基因克隆及编码蛋白和同源物的生物信息学分析》

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蛋白质二级结构主要包括α-螺旋、β-折叠、无规则卷曲和延伸链。通过二级结构，蛋白质进一步形成更高级的三级结构，从而发挥蛋白的活性和功能。利用SOPMA在线分析表明，BSV-YN ORFⅠ及同源物蛋白二级结构主要元件是α-螺旋，含量在73%～88.57%，无规则卷曲含量在10%左右，延伸链在1.70%～9.00%，β-折叠含量大部分在2%以下（表5）。通过使用在线工具SWISS-MODEL对该蛋白质的三级结构进行预测，结果如图5所示，BSV-YN、BSGFV、BSIMV、SCBV和KTSV ORFⅠs的三级结构相似性较高；而PBV、CLNV和ELSV的ORFⅠs