《表5 Of TPS蛋白的二级结构预测结果》
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《桂花萜烯合酶(TPS)的生物信息学与原核表达分析》
运用SPOMA预测TPS二级结构,结果如表5和图1。TPS1蛋白中391个氨基酸形成α-螺旋,占比最多,为67.30%;32个氨基酸形成延伸链,占比5.51%;21个氨基酸形成β-转角,占比3.61%;还有137个形成无规则卷曲,占整条链23.58%。TPS2蛋白中369个氨基酸形成α-螺旋,占比最多,为66.49%;23个氨基酸形成延伸链,占比4.14%;21个氨基酸形成β-转角,占比3.78%;还有142个形成无规则卷曲,占整条链25.59%。TPS3蛋白中399个氨基酸形成α-螺旋,占比最多,为67.51%;25个氨基酸形成延伸链,占比4.23%;17个氨基酸形成β-转角,占比2.88%;还有150个形成无规则卷曲,占整条链25.38%。TPS4蛋白中379个氨基酸形成α-螺旋,占比最多,为69.16%;20个氨基酸形成延伸链,占比3.65%;19个氨基酸形成β-转角,占比3.47%;还有130个形成无规则卷曲,占整条链23.72%。从图1可以看出,TPS1、TPS2、TPS3蛋白在N端均存在延伸链,TPS1的延伸链密度最大,TPS3次之,TPS2较少。TPS4的N基端没有延伸链。TPS1的N端延伸链涵盖59个氨基酸的区域内,TPS2涉及42个氨基酸的区域,TPS3涉及46个氨基酸的区域。
图表编号 | XD0051646200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.05.01 |
作者 | 曾祥玲、邹晶晶、王彩云 |
绘制单位 | 湖北科技学院核技术与化学生物学院、华中农业大学园艺植物生物学教育部重点实验室、湖北科技学院核技术与化学生物学院、华中农业大学园艺植物生物学教育部重点实验室、华中农业大学园艺植物生物学教育部重点实验室 |
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