《表5 Of TPS蛋白的二级结构预测结果》

《表5 Of TPS蛋白的二级结构预测结果》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《桂花萜烯合酶(TPS)的生物信息学与原核表达分析》


  1. 获取 高清版本忘记账户?点击这里登录
  1. 下载图表忘记账户?点击这里登录

运用SPOMA预测TPS二级结构,结果如表5和图1。TPS1蛋白中391个氨基酸形成α-螺旋,占比最多,为67.30%;32个氨基酸形成延伸链,占比5.51%;21个氨基酸形成β-转角,占比3.61%;还有137个形成无规则卷曲,占整条链23.58%。TPS2蛋白中369个氨基酸形成α-螺旋,占比最多,为66.49%;23个氨基酸形成延伸链,占比4.14%;21个氨基酸形成β-转角,占比3.78%;还有142个形成无规则卷曲,占整条链25.59%。TPS3蛋白中399个氨基酸形成α-螺旋,占比最多,为67.51%;25个氨基酸形成延伸链,占比4.23%;17个氨基酸形成β-转角,占比2.88%;还有150个形成无规则卷曲,占整条链25.38%。TPS4蛋白中379个氨基酸形成α-螺旋,占比最多,为69.16%;20个氨基酸形成延伸链,占比3.65%;19个氨基酸形成β-转角,占比3.47%;还有130个形成无规则卷曲,占整条链23.72%。从图1可以看出,TPS1、TPS2、TPS3蛋白在N端均存在延伸链,TPS1的延伸链密度最大,TPS3次之,TPS2较少。TPS4的N基端没有延伸链。TPS1的N端延伸链涵盖59个氨基酸的区域内,TPS2涉及42个氨基酸的区域,TPS3涉及46个氨基酸的区域。