《表3 BSV-YN ORFⅠ蛋白及同源物的一级结构分析》
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《香蕉条斑病毒ORF Ⅰ基因克隆及编码蛋白和同源物的生物信息学分析》
氨基酸序列组成及理化性质分析表明(表3),BSV-YN ORFⅠ与所选的10种同源蛋白ORFⅠs的氨基酸残基数为173~200个,相对分子质量为19.83~23.33 kDa,等电点(pI)为6.04~9.05,负电荷残基数(Asp+Glu)为22~32,正电荷残基数(Arg+Lys)为22~32,脂肪族氨基酸系数为96.99~112.08。不稳定性系数为43.74~65.51,亲疏水性预测范围为-0.882~-0.169,表明这11个蛋白均为不稳定的(>40)、亲水性或水溶性蛋白(负值)。进一步分析BSV-YN、BSGFV、BSUAV和BSIMV等4个BSV病毒种的ORFⅠs,结果表明它们的氨基酸残基数为175~177个,相对分子质量均为20.80 kDa,等电点(pI)为6.98~8.45,所带负电氨基酸残基与所带正电氨基酸残基均在30个左右,亲疏水性为-0.741~-0.606,其蛋白的不稳定系数为45.85~63.27,属于不稳定的、亲水性或水溶性蛋白,与ProtScale在线工具分析的亲疏水性结果一致(图4)。
图表编号 | XD0051348600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.05.10 |
作者 | 黎维丽、余乃通、李俊成、王健华、李宾宾、刘志昕 |
绘制单位 | 海南大学热带农林学院、中国热带农业科学院热带生物技术研究所·海南省微生物学重点实验室·农业农村部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室、中国热带农业科学院热带生物技术研究所·海南省微生物学重点实验室·农业农村部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室、广东省农业科学院果树研究所·广东省热带亚热带果树研究重点实验室、海南大学热带农林学院、海南大学热带农林学院、中国热带农业科学院热带生物技术研究所·海南省微生物学重点实验室·农业农村部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室、中国热带农业科学院热带生物技术研究所· |
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