《表2 AsSPP1蛋白跨膜域结构的预测》
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《白木香信号肽肽酶AsSPP1基因的克隆及表达分析》
通过ProtParam软件预测AsSPP1编码的蛋白分子式为C1805H2818N446O457S20,相对分子质量为38 720.14,理论等电点为9.31,不稳定系数II为37.01,属于稳定蛋白,总平均亲水性GRAVY为0.575,为疏水性蛋白;利用TMHMM 2.0预测白木香AsSPP1有7个跨膜区域(表2),分别起始第7、59、85、137、187、229和285的位置。通过预测发现AsSPP1蛋白的N端在细胞质膜的内侧,C端在细胞质膜的外侧,中间有7个跨膜域的结构(图2)。白木香AsSPP1氨基酸序列与GenBank中其它物种SPP氨基酸序列比对,结果表明AsSPP1氨基酸序列与其它植物SPP一样具有典型的2个保守催化性天门冬酰胺组成的活性中心YD和GLGD,如图3黑框中所示。根据AsSPP1蛋白跨膜区域分析结果,二者分别位于第六和第七个跨膜区域,与Hoshi等(2013)报道的拟南芥SPP一致。AsSPP1氨基酸序列与可可(Theobroma cacao)、香瓜(Cucumis melo)的同源性分别为71.43%、70.93%;而与大肠杆菌(Escherichia coli)和恶性疟原虫(Plasmodium falciparum)的同源性分别为10.41%和24.27%。系统进化树分析结果表明,植物SPP亲缘关系更近。As SPP1蛋白氨基酸序列与可可SPP相似性较高(图4)。
图表编号 | XD0086761400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.05.20 |
作者 | 冯莹莹、刘晓、王金铃、闫雅如、齐博文、吴云、丁宁、高博闻、王晓晖 |
绘制单位 | 北京中医药大学中药学院中药现代研究中心、北京中医药大学中药学院中药现代研究中心、北京中医药大学中药学院中药现代研究中心、北京中医药大学中药学院中药现代研究中心、北京中医药大学中药学院中药现代研究中心、北京中医药大学中药学院中药现代研究中心、北京中医药大学中药学院中药现代研究中心、包头医学院药学院、北京中医药大学中药学院中药现代研究中心 |
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