《表1 该实验中使用的引物序列》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《彩色棉查尔酮合成酶基因GhCHS1的克隆和功能分析》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

下划线:SpeⅠ和AscⅠ的酶切位点；斜体:保护碱基；Gh:陆地棉；CHS:查尔酮合成酶；UBQ7:泛素延伸蛋白；下同

利用Primer Premier Express 5.0软件设计构建病毒干涉载体的引物（V-GhCHS1-F/R）（GenBank No.LOC107897841） ，引物两端分别加上SpeⅠ和AscⅠ的酶切位点（下划线）和保护碱基（斜体）；设计转基因株系鉴定的引物（A-F/R）；设计目的基因GhCHS1 qPCR检测（GhCHS1 F/R）引物；设计qRT-PCR分析的内参引物（GhUBQ7 F/R）（表1） 。从NC-BI和已知棉花基因组（https://www.cottongen.org/）查找到棉花24个CHS基因序列，采用MEGA7.0软件以最大似然法进行系统发育分析，分析1 000次，提高系统发育树分支的置信水平；采用Signa IP4.1 Server（http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/）预测GhCHS蛋白信号肽进行；GhCHS蛋白的亚细胞定位使用Target P 1.1（http://www.cbs.dtu.dk/services/TargetP/）和Wolf-psort（http://www.genscript.com/wolf-psort.html）工具；用SOPMA（https://npsaprabi.ibcp.fr/cgi-bin/secpred＿sopma.pl）预测GhCHS蛋白二级结构；采用Swiss-model（https://swissmodel.expasy.org/）软件进行三级结构建模。