《表1 RNA-Seq数据的比对统计》

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《利用转录组测序分析茄子萼片刺相关差异基因》

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基于边合成边测序（Sequencing By Synthesis，SBS）技术，利用IlluminaHiSeq4000高通量测序平台对双亲、混池的4个cDNA文库进行测序，共获得60.77 Gb的Clean Data，各样品Q30碱基百分比在88.9%以上（表1）。经过原始数据处理，4个文库共获得409 363 358个Clean Reads，利用Bowtie 2软件将Clean reads与参考基因组进行比对，共有311 756 616个比对到基因组，比对效率均大于75.00%。有刺混池和无刺混池分别有104 202 238个和109 191 303个Clean reads比对到参考基因组，其中比对到唯一的位置的Uniq Mapped Reads分别为72.93%和74.14%。以上比对结果表明，从建库到测序等均达到试验要求。