《表1 链特异性RNA-seq数据及其比对结果》

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《基于RNA-seq的木霉长链非编码RNA的生物信息学预测及其重寄生相关性分析》

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注:IC1、IC2分别表示独立培养木霉菌丝样品；BC1、BC2分别表示对峙接触前木霉菌丝样品；AC1、AC2分别表示对峙接触后木霉和镰刀菌混合菌丝样品。下同。

分别收集对峙接触前木霉菌丝（BC）、对峙接触后互作区内混合菌丝（AC）以及独立培养木霉菌丝（IC）用于链特异性转录组测序。每个样品2个重复，分别标注为BC（1/2）、AC（1/2）和IC（1/2）。6个文库测序后总测序序列数量为363×106，质控处理后有效序列总数为333×106（表1）。在IC（1/2）和BC（1/2）文库中，每个文库均有超过97%的有效序列能够与木霉参考基因组进行比对（表1）。在AC1和AC2文库中，只有43%和47%的有效序列能够与木霉参考基因组比对，并且没有发现能同时与NJAU 4742和Foc4基因组比对的测序序列，这说明通过与参考基因组比对可以将2个物种转录组测序序列分开。尽管AC1和AC2中与木霉基因组上的比对序列比例少于50%，但是比对上的序列在基因组上的覆盖度都超过了100层（X）。