《表2 RNA-Seq数据一览表》

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《MT和FGF5调控辽宁绒山羊绒毛生长相关LncRNA的筛选及鉴定》


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样品名称:_1代表左端的reads,_2代表右端的reads;Raw reads:统计原始序列数据;Clean reads:过滤后的测序数据;Clean bases:测序序列个数与其长度的积;Error rate:碱基错误率;Q20、Q30:Phred数值大于20、30的碱基与总碱基数之比;GC含量:含有G和C的碱基数量与占总碱基数之比Sam

对RNA-Seq测序得到的数据质量进行检测的结果如表2.1所示。通过表中数据可知,Error rate表示测序错误率,它与碱基质量有关,同时也受测序仪本身、测序试剂、样品等多个因素共同影响,由表中数据可知碱基错误率较低。Q=-10log10p,其中p值是由Phred计算出,它表示一个碱基被识别错误的可能性,Q值为10表示这个碱有90%的概率是正确的,20就是99%。各个样品中绝大部分reads的Q值均大于20。基GC含量相对较高,表明测序序列较稳定。综上,我们认为各个样品的测序序列都具有较高的质量,可以进行后续分析。