《表1 RNA-Seq平台及其特征》

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《RNA-Seq在AM真菌研究中的应用》

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转录组学的研究内容包括转录本表达谱分析；确定基因的转录结构；对每种转录本在不同发育阶段和不同条件下转录表达水平的变化定量（Wang et al.，2009）。目前研究转录组测序平台主要有以下几种（表1）。正是这些不断产生的更优的测序平台，将转录组测序技术推向了新的高度，利用转录组测序得出的数据可以用来研究基因表达、生物学途径和分子机制，让人们不断从生物的基因、蛋白等微观领域来更深层次解析植物与微生物互作机制。目前可用的测序平台较多，但Sanger法仍然是当今测序的主流，虽然其原理可靠，优点突出，但是改进的空间还是很大，面临模板制备、荧光标记、信号读取和酶反应体系等多方面技术的挑战，另外，基于本身原理的限制，Sanger法需要多次洗脱，费时费试剂。因此，需要进一步优化和发展，开发出准确率高、读长较长、成本低、速度快的新一代测序平台。