《表1 RNA-Seq数据汇总》
对感染72 h及未感染PCV2的HeLa细胞进行的转录组RNA序列分析,结果如表1所示。在感染PCV2的HeLa细胞中共鉴定出387个DEGs,包括267个上调基因和120个下调基因(表1,图1A)。在387个DEGs中,291个基因与生物过程有关。因此,选取生物过程(biological process)的差异基因做进一步GO分类分析。结果显示共有212个基因上调,79个基因下调。此外,调控基因可分为15个功能组别(图1B、1C),表明PCV2感染可上调或下调多种人类基因。在上调基因中,占比前四的组别分别是生物调控(biological regulation)、刺激应答(response to stimulus)、细胞过程(cellular process)以及代谢过程(metabolic process),分别占上调基因总数的15%、11%、10.8%和10.7%(图1B)。在下调基因中,同样是生物调控、刺激应答、细胞过程和代谢过程这几个功能组别占比较高,分别为16.9%、8.7%、17.2%和10.6%(图1C)。
图表编号 | XD00178844000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.06.30 |
作者 | 刘小花、徐鹏、张昕薇、欧阳婷、吉卫龙、刘晓慧、任林柱 |
绘制单位 | 吉林大学动物科学学院、吉林大学动物科学学院、吉林大学动物科学学院、吉林大学动物科学学院、吉林大学动物科学学院、吉林大学动物科学学院、吉林大学动物科学学院 |
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