《表2 数据产出质量统计：鼠伤寒沙门菌baeSR和acrB双基因缺失株相关耐药基因的RNA-seq分析》

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《鼠伤寒沙门菌baeSR和acrB双基因缺失株相关耐药基因的RNA-seq分析》

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检测样品中CR、CR△acrB和CR△baeSR△acrB的质量浓度分别为1 188，372和688 ng/μL；OD260/280分别为2.077、2.11和2.02，OD260/230分别为2.055、1.01和0.76，满足建库测序的要求。从转录组测序数据分析报告中得知，CR、CR△acrB和CR△baeSR△acrB分别获得11 693 470、13 342 112和108 24 816条原始序列，对原始数据进行过滤后，剔除低质量数据的Clean reads分别为11 311 842、12 959 780和10 500 966，其错误率分别为0.03%、0.02%和0.02%。通过Bowtie2将过滤后的测序序列进行基因组定位分析，结果显示鼠伤寒沙门菌CR、CR△acrB和CR△baeSR△acrB的比对结果分别是95.74%、97.60%和97.19%（表2）。该结果证明本次测序准确性较高，后续可直接用该部分数据进行分析。