《表2 质控后数据统计表:基于RNA-seq技术的罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)不同组织转录组比较分析》

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《基于RNA-seq技术的罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)不同组织转录组比较分析》


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罗氏沼虾7个不同组织测序共得到344151324条原始序列,质控后得到有效RNA-seq 311475706条。每个个体的测序量为6.65—9.04 Gb,平均7.38 Gb。去除接头序列,截去连续4个碱基平均质量值低于20的部分,舍去长度少于50 bp的reads。共得到311475706条reads。过滤后每个个体的测序量为5.3—8.45 Gb,平均6.60 Gb(见表2)。每个个体的测序量为每4个碱基的平均质量值均大于20。