《表3 组装结果统计:RNA-Seq定量分析盐肤木对铅胁迫的响应》

《表3 组装结果统计:RNA-Seq定量分析盐肤木对铅胁迫的响应》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《RNA-Seq定量分析盐肤木对铅胁迫的响应》


  1. 获取 高清版本忘记账户?点击这里登录
  1. 下载图表忘记账户?点击这里登录

使用短reads比对软件Bowtie 2[19]将高质量clean reads比对参考基因序列(表2),CK、Pb250、Pb1000与参考基因的匹配率分别为85.69%、84.58%、84.56%,表明测序数据可用性较高。使用短reads组装软件Trinity[20]做转录组从头组装(表3)发现,转录本拼接长度大多集中在200~299 nt,转录本长度介于201~15 581 nt,N50值为1566,拼装组装效果符合要求。