《表3 组装结果统计:RNA-Seq定量分析盐肤木对铅胁迫的响应》
使用短reads比对软件Bowtie 2[19]将高质量clean reads比对参考基因序列(表2),CK、Pb250、Pb1000与参考基因的匹配率分别为85.69%、84.58%、84.56%,表明测序数据可用性较高。使用短reads组装软件Trinity[20]做转录组从头组装(表3)发现,转录本拼接长度大多集中在200~299 nt,转录本长度介于201~15 581 nt,N50值为1566,拼装组装效果符合要求。
图表编号 | XD0071317000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.07.20 |
作者 | 夏丽丹、张虹、胡华英、曹升、周垂帆 |
绘制单位 | 福建农林大学林学院、海峡两岸水土保持协同创新中心、福建长汀红壤丘陵生态系统国家定位观测研究站、福建农林大学林学院、海峡两岸水土保持协同创新中心、福建长汀红壤丘陵生态系统国家定位观测研究站、福建农林大学林学院、海峡两岸水土保持协同创新中心、福建长汀红壤丘陵生态系统国家定位观测研究站、福建农林大学林学院、海峡两岸水土保持协同创新中心、福建长汀红壤丘陵生态系统国家定位观测研究站、福建农林大学林学院、海峡两岸水土保持协同创新中心、福建长汀红壤丘陵生态系统国家定位观测研究站 |
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