《表1 转录组分析得到的KCR信息》

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《蒜头果中3-酮酯酰-CoA还原酶基因克隆与功能分析》


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通过Illumina Hiseq2000平台测序对蒜头果果实转录组测序,总计产出6 299 384 146 bp数据。组装结果得到165 110个Unigene。对所获得的Unigene进行本地Blast以及在NR、NT、Swiss-Prot、KEGG、COG、GO等数据库比对分析,最终获得11个可能的KCR基因片段(表1)。根据已知其他植物KCR基因大小在1 kb以上,从转录组数据中最终得到大于1 kb的KCR基因片段有1个。通过蛋白序列分析以及表达量分析最后确定c53962_g1作为后续克隆分析的对象。