《表1 转录组分析得到的GGPS信息》

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《高产脂思茅松牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因的克隆及表达》


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采用Illumina Hiseq 2000平台对高、低产脂思茅松割脂后伤口附近的树皮进行转录组测序,总计产出5 828 966 460 nt数据,组装结果得到59 636个Unigene.对所获得的Unigene进行本地Blast,并在NR、NT、Swiss-Prot、KEGG、COG、GO等数据库中进行比对分析,最终获得13个可能的GGPS基因片段(表1).根据已知其他植物GGPS基因的大小在1 000 bp以上,从转录组数据中最终得到大于1 000bp的GGPS基因片段有2个.通过蛋白序列分析以及表达量分析最后确定Unigene9201(表1)作为后续克隆分析的对象.